Os culpados causadores de câncer podem ser pegos por suas impressões digitais de DNA

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As causas do câncer estão sendo catalogadas por meio de um estudo internacional que revela as impressões digitais genéticas de processos que danificam o DNA que impulsionam o desenvolvimento do câncer. Pesquisadores da Faculdade de Medicina da Universidade da Califórnia em San Diego, Instituto Wellcome Sanger, Faculdade de Medicina Duke-NUS Cingapura, Instituto Amplo do MIT e Harvard, com colaboradores em todo o mundo, criaram a lista mais detalhada ainda dessas impressões digitais genéticas, fornecendo pistas a como cada câncer se desenvolve.

Essas impressões digitais permitirão que os cientistas procurem produtos químicos anteriormente desconhecidos, vias biológicas e agentes ambientais responsáveis ​​por causar câncer.

“Identificamos quase todos os genomas de câncer disponíveis publicamente no início deste projeto e analisamos todas as suas seqüências genômicas”, disse o primeiro autor Ludmil B. Alexandrov, PhD, professor assistente dos departamentos de Medicina Celular e Molecular e Bioengenharia da UC San Diego. . “Os dados desses milhares de cânceres nos permitiram descrever assinaturas mutacionais com muito mais detalhes, e estamos confiantes de que agora conhecemos a maioria das assinaturas existentes”.

A pesquisa, publicada em 5 de fevereiro de 2020 em

Natureza
como parte do Projeto Pan-Câncer global, ajudará a delinear as causas do câncer, informar estratégias de prevenção e definir novas direções para o diagnóstico e tratamento do câncer.

Nos Estados Unidos, o Instituto Nacional do Câncer estima que 1,7 milhão de novos casos de câncer foram diagnosticados em 2018 e mais de 600.000 pessoas morreram com a doença. Aproximadamente 38% dos homens e mulheres neste país serão diagnosticados com câncer durante a vida.

O câncer é causado por alterações genéticas – mutações – no DNA de uma célula, levando a célula a se dividir incontrolavelmente. Muitas causas conhecidas de câncer, como luz ultravioleta e uso de tabaco, deixam uma impressão digital específica de dano no DNA, conhecido como assinatura mutacional. Essas impressões digitais podem ajudar a entender como os cânceres se desenvolvem e, potencialmente, como eles podem ser prevenidos. No entanto, estudos anteriores não foram grandes o suficiente para identificar todas as assinaturas mutacionais em potencial.

“Usando nosso catálogo detalhado da gama de assinaturas mutacionais no DNA do câncer, pesquisadores de todo o mundo agora poderão investigar quais produtos químicos ou processos estão vinculados a essas assinaturas”, disse o co-autor sênior Mike Stratton, PhD, diretor do Instituto Wellcome Sanger. . “Isso aumentará nossa compreensão de como o câncer se desenvolve e descobrirá novas causas, ajudando a informar estratégias de saúde pública para prevenir o câncer”.

Este estudo identificou novas assinaturas mutacionais que não haviam sido vistas antes, desde mutações de erro de letra única até inserções e deleções ligeiramente maiores do código genético. O resultado é o maior banco de dados de assinaturas mutacionais de referência. Apenas cerca de metade de todas as assinaturas mutacionais têm causas conhecidas.

“Alguns tipos dessas impressões digitais do DNA, ou assinaturas mutacionais, refletem como o câncer pode responder aos medicamentos”, disse o co-autor sênior Steven Rozen, PhD, diretor do Center for Computational Biology e professor de câncer e células-tronco da Duke- Faculdade de Medicina da NUS. “Mais pesquisas sobre isso podem ajudar a diagnosticar alguns tipos de câncer e a quais drogas eles podem responder”.

O Projeto Pan-Cancer global é o maior e mais abrangente estudo de genomas de câncer inteiro. A colaboração criou um enorme recurso de genomas primários de câncer, disponível para pesquisadores de todo o mundo para avançar na pesquisa.

“A disponibilidade de um grande número de genomas inteiros nos permitiu aplicar métodos analíticos mais avançados para descobrir e refinar assinaturas mutacionais e expandir nosso estudo em tipos adicionais de mutações”, disse o co-autor sênior Get Getz, PhD, membro do instituto Broad Instituto do MIT e Harvard, professor de patologia na Harvard Medical School e membro do corpo docente e diretor de bioinformática do Massachusetts General Hospital Cancer Center.

“Nossa nova coleção de assinaturas fornece uma imagem mais completa dos processos biológicos e químicos que danificam ou reparam o DNA e permitirá que os pesquisadores decifrem os processos mutacionais que afetam o genoma dos cânceres recém-sequenciados”.

Faculdade de Medicina da UC San Diego

Fundada em 1968, a Faculdade de Medicina da Universidade da Califórnia em San Diego é consistentemente classificada entre os melhores programas de faculdades de medicina do país para atendimento primário e pesquisa por
Notícias dos EUA e Relatório Mundial e entre as 10 melhores escolas médicas para financiamento total dos Institutos Nacionais de Saúde. A escola é reconhecida internacionalmente como um local onde as descobertas são realizadas – levando inovações do laboratório de pesquisa às cabeceiras dos pacientes. Os membros do corpo docente cuidam de pacientes na UC San Diego Health, onde a atenção primária está disponível em vários locais convenientes em todo o Condado de San Diego e nosso atendimento especializado avançado está sempre entre os melhores do país. Para mais informações, visite medschool.ucsd.edu.

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O Instituto Wellcome Sanger

O Wellcome Sanger Institute é um centro de pesquisa de genômica líder mundial. Realizamos pesquisas em larga escala que formam as bases do conhecimento em biologia e medicina. Somos abertos e colaborativos; nossos dados, resultados, ferramentas e tecnologias são compartilhados em todo o mundo para promover a ciência. Nossa ambição é vasta – assumimos projetos que não são possíveis em nenhum outro lugar. Usamos o poder do seqüenciamento do genoma para entender e aproveitar as informações no DNA. Financiados pela Wellcome, temos a liberdade e o apoio para ultrapassar os limites da genômica. Nossas descobertas são usadas para melhorar a saúde e entender a vida na Terra. Saiba mais em www.sanger.ac.uk ou siga-nos no
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Sobre a Duke-NUS Medical School

A Duke-NUS é a principal escola médica de Cingapura, criada em 2005 com uma parceria estratégica liderada pelo governo entre duas instituições de classe mundial: a Duke University School of Medicine e a Universidade Nacional de Cingapura (NUS). Por meio de um currículo inovador, os alunos da Duke-NUS são incentivados a se tornarem ‘Clinicians Plus’ multifacetados, prontos para orientar o ecossistema biomédico e de saúde em Cingapura e além. Líder em pesquisa inovadora e inovação em tradução, a Duke-NUS ganhou fama internacional por meio de cinco programas de pesquisa exclusivos e nove centros. O impacto duradouro de suas descobertas é amplificado pela parceria bem-sucedida de Medicina Acadêmica com os Serviços de Saúde de Cingapura (SingHealth), o maior grupo de assistência médica de Cingapura. Essa aliança estratégica gerou 15 Programas Clínicos Acadêmicos, que utilizam pesquisa e educação multidisciplinares para transformar a medicina e melhorar vidas. Para mais informações por favor visite
   duke-nus.edu.sg.

Sobre o Instituto Amplo do MIT e Harvard

O Broad Institute of MIT e Harvard foi lançado em 2004 para capacitar essa geração de cientistas criativos a transformar a medicina. O Broad Institute procura descrever todos os componentes moleculares da vida e suas conexões; descobrir a base molecular das principais doenças humanas; desenvolver novas abordagens eficazes para diagnóstico e terapêutica; e disseminar descobertas, ferramentas, métodos e dados abertamente para toda a comunidade científica. Fundado pelo MIT, Harvard, hospitais afiliados a Harvard e pelos visionários filantropos de Los Angeles Eli e Edythe L. Broad, o Broad Institute inclui corpo docente, equipe profissional e estudantes de todas as comunidades de pesquisa biomédica do MIT e Harvard e além, com colaborações que abrangem mais de cem instituições públicas e privadas em mais de 40 países em todo o mundo. Para mais informações sobre o Broad Institute, acesse
   www.broadinstitute.org.

Os co-autores incluem: Erik N. Bergstrom e S. M. Ashiqul Islam da UC San Diego; Jaegil Kim, Instituto Amplo do MIT e Harvard; Nicholas J. Haradhvala e Gad Getz, Instituto Amplo do MIT e Harvard, e Hospital Geral de Massachusetts; Mi Ni Huang, Alvin Wei Tian Ng, Yang Wu, Arnoud Boot e John R. McPherson da Duke-NUS Medical School; Kyle R. Covington e David A. Wheeler, da Faculdade de Medicina de Baylor; Dmitry A. Gordenin e Leszek J. Klimczak do Instituto Nacional de Ciências da Saúde Ambiental; Nuria Lopez-Bigas, Instituto de Ciência e Tecnologia de Barcelona, ​​Universitat Pompeu Fabra e Institutio Catalana de Recerca i Estudis Avancats; Sandro Morganella, Instituto Wellcome Sanger; Radhakrishnan Sabarinathan, Universidade Pompeu Fabra, Instituto de Pesquisa Fundamental Tata e Instituto de Pesquisa em Biomedicina; Ville Mustonen, Universidade de Helsinque; e o Grupo de Trabalho para Análise de Câncer de Pan de Cânceres Inteiros do Genoma Consortium.

O financiamento para essa pesquisa veio, em parte, do subsídio Wellcome (206194), Conselho Nacional de Pesquisa Médica de Cingapura (NMRC / CIRG / 1422/2015, MOH-000032 / MOHCIRG18may-0004), Ministério da Saúde de Cingapura, via assinatura Duke-NUS Programas de Pesquisa, Institutos Nacionais de Saúde (Z1AES103266), Consolidador do Conselho Europeu de Pesquisa (682398), Instituto Nacional de Câncer (U24CA143843, U24CA210999, U24CA143845) e Prêmio Grand Challenge de Pesquisa do Câncer do Reino Unido (C98 / A24032).

Divulgações: Gad Getz recebe fundos de pesquisa da IBM e da Pharmacyclics e é um inventor de pedidos de patentes relacionadas ao MuTect, ABSOLUTE, MutSig, MSMuTect e POLYSOLVER.



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Luiz Presso
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